在开发汽车维修保养小程序自助下单自助缴费的原生系统APP时，关键模块的设计至关重要。以下是一些核心功能模块，这些模块能够确保用户获得高效、便捷的汽车维修保养服务体验：

车辆信息管理：用户可以录入车辆的基本信息，包括品牌、型号、购买日期、行驶里程等。系统根据这些信息自动计算保养周期，并为用户提供个性化的保养建议。

个人信息管理：用户可以在此模块中管理自己的个人信息，如姓名、联系方式、地址等，方便系统提供的服务推送和售后服务。

在线预约服务：用户可以根据自身时间安排预约保养维修服务，选择服务项目、指定技师及服务时间。系统应提供灵活的预约选项，以满足不同用户的需求。

服务进度追踪：用户可以通过小程序实时查看车辆保养维修的进度，获取维修报告，并在服务完成后接收满意度调查反馈，确保服务质量。

保养套餐展示：清晰展示各项保养套餐的内容、价格及优惠政策，帮助用户了解并选择适合自己的保养方案。

在线支付功能：支持用户通过小程序进行一键支付，简化交易过程，提高支付效率。系统应支持多种支付方式，以满足不同用户的支付需求。

门店导航功能：内置地图导航功能，帮助用户快速找到近的服务网点。系统应提供准确的门店信息和路线规划，方便用户到店接受服务。

在线客服系统：配备在线客服系统，解答用户在使用小程序过程中遇到的疑问，提供及时有效的售后服务。客服人员应具备知识，能够为用户提供的汽车维修保养建议。

会员积分系统：建立会员积分系统，鼓励用户通过签到、消费等方式积累积分，兑换礼品或享受优惠服务。这有助于提升用户粘性和复购率。

营销活动发布：定期发布优惠券、折扣活动等营销策略，吸引新用户并留住老用户。系统应支持活动的灵活配置和推送，以确保营销效果的大化。

综上所述，开发汽车维修保养小程序自助下单自助缴费的原生系统APP时，应重点关注用户管理、服务预约、保养套餐与支付、门店导航与客服以及会员体系与营销等关键模块。这些模块的设计和实现将直接影响用户的使用体验和满意度。