开发一个心理健康评测、线上付费匿名咨询以及一对一心理咨询的原生系统软件，需要综合考虑多个关键模块来确保系统的功能完善、用户体验良好且数据安全。以下是一些关键模块的建议：

注册与登录：支持邮箱、手机号、社交媒体账号等多种注册方式，并提供密码找回功能。

个人信息管理：允许用户编辑个人资料，包括昵称、性别、年龄、职业等（部分信息可选填，以支持匿名性）。

匿名与隐私设置：提供用户选择是否公开部分或全部个人信息的选项，确保匿名性。

评测问卷库：内置多种心理健康评测问卷，如焦虑、抑郁、压力等评测量表。

自动评测与结果解读：用户完成评测后，系统自动计算分数并生成解读报告，同时提供建议或引导至下一步咨询。

历史记录：保存用户的评测历史，方便追踪心理健康变化。

支付接口集成：与支付宝、微信支付、信用卡等主流支付方式对接，确保支付安全便捷。

套餐与单价设置：提供多种咨询套餐和单价选择，满足不同用户需求。

订单管理：用户可查看订单状态、历史记录及发票信息。

即时通讯：提供文字、语音、视频等多种咨询方式，确保沟通顺畅。

咨询师匹配：根据用户需求和咨询师专长进行智能匹配，或允许用户自主选择咨询师。

匿名保护：确保咨询过程中的信息交换保持匿名，保护用户隐私。

预约管理：用户可预约咨询时间，咨询师确认后形成正式咨询安排。

咨询记录：保存咨询过程中的聊天记录、文件共享等，便于后续回顾。

反馈与评价：咨询结束后，用户可对咨询师进行反馈和评价，帮助提升服务质量。

数据加密：对敏感数据进行加密存储和传输，确保数据安全。

隐私政策：明确用户数据的收集、使用和保护规则，遵守相关法律法规。

权限管理：对不同角色（用户、咨询师、管理员）设置不同的数据访问权限。

用户管理：管理员可查看用户信息、处理异常账户等。

咨询师管理：管理咨询师的资质审核、排班、业绩统计等。

数据分析：分析用户行为、咨询效果等数据，为优化服务提供依据。

稳定性监控：实时监控系统运行状态，及时发现并处理异常。

版本迭代：根据用户反馈和市场需求，定期更新系统功能和完善用户体验。

综上所述，开发一个心理健康评测、线上付费匿名咨询以及一对一心理咨询的原生系统软件需要综合考虑多个关键模块，以确保系统的全面性、安全性和易用性。